1258 年，旭烈兀攻陷巴格达，立国五百余年的阿拔斯王朝(黑衣大食)灭亡。1260年初，蒙古军又攻克了今天叙利亚的重镇阿勒颇与大马士革。这年夏天，蒙古军的先锋已经抵达加沙。
1259年蒙哥大汗去世，忽必烈和阿里不哥争位的消息传到旭烈兀军营，旭烈兀命前锋怯的不花镇守叙利亚，自己率领主力于1260年 6月26日东回大不里士（今伊朗西北部）, 建立伊利汗国。
旭烈兀遣使埃及，要求马穆鲁克王朝素丹投降。统治埃及的马穆鲁克斩杀蒙古使者及其随从。1260 年7月16日，埃及最高统治者库土斯亲率倾国之兵（大约3万人）离开埃及，开赴叙利亚，俘杀怯的不花, 重夺直到幼发拉底河的叙利亚地区。
1260年10月24日，马穆鲁克王朝素大将拜伯尔斯由于没有获得阿勒颇作为封地，在叙利亚回兵埃及的路上，把库土斯砍了，并夺了素丹的王位。
两个月后，1260年11月底，一支蒙古军队重新进入叙利亚，再次抢掠了阿勒颇。
实际上，伊利汗国的主要目标是叙利亚而不是埃及。伊利汗国必须控制叙利亚，才能掌握地中海东部沿海地区，与西方世界展开直接贸易的出海口。
旭烈兀与“黄金家族”在钦察汗国（即金帐汗国）与察合台汗国的亲戚们发生了分裂。伊利汗国占据的外高加索地区（里海和黑海之间的陆路地区）是金帐汗国唯一一条通向南方地中海、黑海地区的通道。1262年起，旭烈兀与别儿哥为争夺阿塞拜疆的地盘兵戎相见，旭烈兀先胜后败，不久去世（1265年）。
别儿哥趁旭烈兀之子登基未久，以30万骑兵南下，在一条河边被伊尔汗国的军队阻止，两军隔河相互射箭，相持了14天。最后别儿哥病死。到了1280年，新任金帐汗脱脱蒙哥再次入侵伊利汗国，也战败，最后一命呜呼。
十年之后，金帐汗忙哥帖木儿又率一万多人入侵伊利汗国，又被杀死三百人，俘虏若干……
1270年，觊觎伊利汗国土地的察合台汗八刺也进兵伊利汗国，被伊利汗国打得落花流水，仅带着五千残兵逃回。
1272年伊利汗派军侵入察合台汗国、次年更攻入察哈台汗国的首府，纵兵一周，带回波斯的俘虏达五万人之多。
两个蒙古国家在外高加索地区断断续续打了了一个世纪，两败俱伤。大不里士的统治者焦头烂额，不暇他顾。
1261 年，奴隶出身的新兴统治者拜伯尔斯把自己的的叔父，逃亡到大马士革的前阿拔斯王朝末代哈里发请到开罗，在市中心的大清真寺举行盛大仪式，请他就任哈里发，称穆斯坦绥尔，诏告伊斯兰世界。
新任哈里发在同一清真寺为拜伯尔斯穿上阿拔斯王朝的黑色长袍，册封为全世界的素丹。马穆鲁克王朝成了合法的穆斯林王朝，开罗也成了阿拉伯帝国的中心。
伊利汗国在与蒙古国家的内战间隙中终于腾出手来进军叙利亚时，面对的已经是一个更为强大的马穆鲁克王朝。
1277年，马穆鲁克军队进攻今天土耳其境内的蒙古驻军，当地的蒙古军统帅阵亡，1.4万蒙古军大多战死。
1281 年，5 万伊利汗国的蒙古军，在3万亚美尼亚人、格鲁吉亚人等基督教盟军协助下进军叙利亚。初战双方互有胜负，后来素丹亲临战场指挥并遣将诈降，蒙古军统帅遭突袭，坠马而逃，蒙古军大乱。马穆鲁克人乘机发起总攻，收复阿勒颇，再一次将蒙古人逐出叙利亚。
1299年，合赞汗进行全国动员集结了九万骑兵入侵叙利亚，击败马穆鲁克军队并重夺大马士革。但当第二年2月合赞汗返回大不里士后，征服地相继叛归马穆鲁克，蒙古人在叙利亚所统治的时间不足百天。
合赞汗遂于1300年又命统帅忽都鲁沙进军叙利亚，由于天气严寒，不利作战，合赞汗提出议和，条件是要求马穆鲁克称臣，遭到了马穆鲁克的拒绝。
合赞汗于1303年三征叙利亚。作为先锋的5万蒙古军与马穆鲁克军队于4月20日在大马士革附近的苏法尔草原激战，全军溃败，死伤不计其数。埃及军奋勇追击，俘虏蒙古士兵1万余人，缴获战马2万匹，给蒙古军以毁灭性打击。11月，合赞汗只能撤军回波斯。
1312 年，一支小规模的蒙古军尝试攻掠叙利亚，结果无功而返。这也是蒙古军最后一次越过幼发拉底河。这时的“埃及、叙利亚和希贾兹素丹国（指马穆鲁克），成为了伊斯兰世界的支柱和穆斯林的宗教堡垒”。
